graph즉 오픈 소스 그래프 시각화 소프트웨어입니다. 그것은 여러 가지 주요 레이아웃 프로그램. 샘플 레이아웃 갤러리를 참조 하십시오. 또한 웹 및 대화형 그래픽 인터페이스와 보조 도구, 라이브러리 및 언어 바인딩이 있습니다. 우리는 GUI 편집자로 많은 일을 끼워 넣을 수 없다 그러나 확실히 약간 외부 프로젝트 및 graphor를 통합 하는 상업적인 공구 조차 있다. 당신은 자원 섹션에서 이러한 중 일부를 찾을 수 있습니다. 네트워크 레이블 위치 선택 도트 앱은 “네트워크 레이블 없음”, “Top” 및 “bottom” 옵션을 제공 하 여 사용자가 네트워크 자체에 레이블을 지정 해야 하는지 여부와 레이블 위치를 지정할 수 있도록 합니다. “Top” 및 “bottom” 옵션을 선택 하면 그래프의 “laboloc” 특성과 “label” 특성이 출력 된 graphis 파일에 기록 됩니다. 게다가, “상표” 속성은 cytoscape에 있는 네트워크의 이름에 놓일 것 이다. 반면, “No 네트워크 레이블” 옵션을 모두 “labreloc” 특성과 “레이블” 특성을 생략 합니다. 사용자는 그림 2와 같이 “로드할 네트워크 파일” 이라는 제목의 파일 브라우저 대화 상자가 표시 됩니다. 사용자는 “유형의 파일”에 대 한 드롭다운 메뉴에서 “grapgraphers 파일 (* .gv, * .dot)”을 선택 하 여 대화 상자를 필터링 할 수 있습니다.

확장명이 .dot 인 grapgraphers 파일 및 .gv의 확장자를 가진 graphhe 파일 사이에는 차이점이 없습니다. 그러나 Microsoft Word의 버전도 .dot 확장명 (https://marc.info/?l=graphviz-devel&m=129418103126092)을 사용 하기 때문에 .gv 확장명이 선호 됩니다. 이 시점에서, graphis 네트워크를 가져오는 것은 cytoscape의 받아들여진 파일 형식 어떤에서 네트워크를 가져오기와 동일 하. 그 단계는 cytoscape 사용자 설명서 (http://manual.cytoscape.org/en/stable/)에 자세히 설명 되어 있습니다. graphit 네트워크는 세 가지 방법으로 가져올 수 있습니다: 시작 화면에서 (네트워크 파일에서 “를 통해 …” 버튼), 메뉴에서 (“파일-> 가져오기-> 네트워크-> 파일 …”), 또는 도구 모음에서 (“가져오기 네트워크 파일에서” 버튼을 클릭 하 여). 지원 되지 않는 점 기능. 다음은 가져오기에서 지원 되지 않는 기능입니다. 그림 13은 cytoscape 버전 3.5.1로 가져오는 결과를 보여줍니다. 기본 도트 파일은 cytoscape에 상응 하는 특성을 사용 하는 도트 애플 리 케이 션 충실 한 재생산을 만듭니다.

두 부분 사이의 작은 차이는 노드 테두리의 너비입니다. 이는 cytoscape와 graphis가 너비 1로 노드 테두리를 렌더링 하는 방법의 차이 때문입니다. graphhe는 (.dot, .gv) 그래프 구조, 레이아웃 및 스타일링 정보를 포함 하는 파일을 생성 하는 인기 있는, 잘 설립 된 그래프 시각화 응용 프로그램 이지만,이는 cytoscape에 대 한 입력/내보내기 모듈이 없습니다. 도트 파일은 도트 언어 구문 (http://www.graphviz.org/doc/info/lang.html)을 따릅니다. xgmml 및 graphml, grapeor 및 그 도트 언어 구문에 비해 더 많은 시각적 특성을 정의 하 고 다른 색상의 여러 가장자리로 표현 되는 색 세그먼트와 단일 가장자리로 구성 된 가장자리와 같은 더 많은 시각적 기능을 지원 합니다. 일부 특성은 소프트웨어에서 사용 하는 레이아웃 알고리즘에 대 한 매개 변수를 지정 하기 때문에 grapgraphers 소프트웨어 에서만 사용할 수 있습니다.